昂儒昂苏丹国（-）
Alimah三世年-年萨利姆年-年赛迪·Ahamd年-年阿卜杜拉一世年-年哈莉玛年-年阿卜杜拉一世（复位）年-年阿拉维·侯赛因年-年阿卜杜拉二世·本·阿拉维年-年阿里·萨利姆年-年阿卜杜拉二世·本·阿拉维（复位）年-年赛迪·阿拉维·本·阿卜杜拉年-年萨利姆·本·阿拉维·本年-年赛迪·阿卜杜拉·本·萨利姆年-年2月2日萨利姆·本·阿卜杜拉年2月-年4月2日赛迪·奥马尔·哈桑·赛义迪年4月2日-年4月14日赛义迪·穆罕默德·赛义迪·奥马尔年4月14日-年姆瓦里苏丹国（-）
Ramanetaka年-年Raketaka·琼布·Sudy年-年穆罕默德·哈玛迪·马卡达拉年-年琼布·法蒂玛·宾特年-年Abderremane·哈玛迪·马卡达拉年-年穆罕默德·Shekhe年-年Marjani·本·阿卜杜·Shekhe年-年萨利马·哈玛迪·马卡达拉年-年法属马约特保护地（-）
年法国入侵马约特岛。年6月成为法国殖民地，隶属于法兰西岛-留尼汪；年8月11日起，隶属于留尼汪。
皮埃尔·帕索年6月-年3月11日保罗·查尔斯·Rang年3月11日-年6月17日查尔斯·路易斯·西博尔特（代理）年6月17日-年10月22日奥古斯特·勒布伦（代理）年10月22日-年1月皮埃尔·帕索年1月-年8月斯坦尼斯拉斯·利维年8月11日-年6月13日菲利贝尔·邦菲尔斯年6月13日-年10月18日安德烈·布里塞特（署理）年10月18日-年12月13日奥古斯特·约瑟夫·Verand年12月13日-年8月15日查尔斯·奥古斯特·莫雷尔年8月15日-年8月14日查尔斯·Gabrié年8月14日-年12月14日约瑟夫·克里斯托夫·科洛姆年12月14日-年7月8日约瑟夫·费迪南德·海耶斯（署理）年7月8日-年4月15日LJ·勒盖（署理）年4月15日-年5月21日约瑟夫·克里斯托夫·科洛姆年5月21日-年3月4日帕特里斯·路易·图卢布尔年3月4日-年3月1日克劳德·方丹（署理）年3月1日-年9月16日弗朗索瓦·玛丽·Ferriez（署理）年9月16日-年12月26日帕特里斯·路易·图卢布尔年12月26日-年1月2日让·罗布林（代理）年1月2日-年12月9日查尔斯·瓦萨尔（代理）年12月9日-年9月7日查尔斯·巴耶（代理）年9月7日-年12月16日爱德华·Sasias（代理）年12月16日-年12月31日弗朗索瓦·玛丽·Ferriez年12月31日-年3月3日安妮·热维尔-雷亚什年3月3日-年6月24日法属大科摩罗、昂儒昂岛、姆瓦里莫埃利保护地（-）
安妮·热维尔-雷亚什年6月24日-年8月保罗·路易·布兰维尔年8月19日-年9月5日法属科摩罗保护地（-）
年4月9日，法属科摩罗保护地成为马达加斯加的属地。
保罗·赛扬·布兰维尔年9月5日-年5月4日克洛维斯·Papinaud年5月4日-年艾蒂安·拉科卡德年到年3月30日让蒂安·Pereton年3月30日-年8月5日路易·米康年8月5日-年3月7日克洛维斯·Papinaud年3月7日-年9月18日皮埃尔·奥古斯特·帕斯卡年9月18日-年10月15日阿尔弗雷德·马蒂诺年10月15日-年2月28日让·奥古斯特·乔利埃特年2月28日-年3月3日弗尔南多·富罗年3月3日-年9月8日查尔斯·亨利·韦尔涅年9月8日-年5月1日弗雷德里克·Estèbe年5月1日-年9月28日法属马约特属地（-）
年，法属马约特并入马达加斯加。
加布里埃尔·卡尼尔-穆顿年7月25日-年2月21日奥诺雷·卡特伦年2月21日-年法属科摩罗海外领地（-）
欧仁·阿兰·路易斯·阿拉尼乌年10月24日-年12月31日罗杰·玛丽·阿道夫·雷米（代理）年12月31日-12月年埃尔·伦纳德·阿尔方斯·高特年12月-年4月21日皮乔治·维克多·莫里斯·阿尔诺年4月21日-年6月30日乔治·加布里埃尔·约瑟夫（代理）年6月30日-年12月14日路易斯·约瑟夫·爱德华·萨吉年12月14日-年5月22日伊夫·达鲁瓦尔年5月22日-年2月15日亨利·约瑟夫·玛丽·伯纳德年2月15日-年7月26日安托万·Padoua·科洛姆巴里年7月26日-年11月雅克·莫拉迪安年11月-年7月科摩罗国（-）
艾哈迈德·阿卜杜拉·阿卜杜拉曼年7月6日-年8月3日科摩罗民主联盟赛义德·穆罕默德·贾法尔年8月3日-年1月3日联合国家阵线阿里·萨利赫年1月3日-年5月13日人民民主大会赛义德·阿特绍马尼年5月13日-年5月23日联合国家阵线科摩罗伊斯兰联邦共和国（-）
艾哈迈德·阿卜杜拉·阿卜杜拉曼年5月23日-年11月26日科摩罗民主联盟哈里帮·切班尼年11月26日-年11月27日科摩罗发展联盟赛义德·穆罕默德·乔哈尔年11月27日-年9月29日科摩罗进步联盟阿尤巴·康博年9月29日-年10月2日军人穆罕默德·塔基·阿卜杜勒-卡里姆年10月2日-年10月5日全国民主联盟卡阿比·埃尔-亚什鲁图·穆罕默德年10月5日-年1月26日CHUMA赛义德·穆罕默德·乔哈尔年1月26日-年3月25日民主复兴集会穆罕默德·塔基·阿卜杜勒-卡里姆年3月25日-年11月6日全国发展塔杰丁·赛义德·马松德（临时）年11月6日-年4月30日无党派阿扎利·阿苏马尼年4月30日-年12月23日军人昂儒昂岛自治政府（-）
年8月5日，昂儒昂岛宣布独立，建立昂儒昂国。年3月10日，经全民公投，取消独立，成为科摩罗联盟的一个自治区。
Foundi·阿卜杜拉·易卜拉欣年8月5日-年8月1日昂儒昂岛人运动阿贝德·阿卜杜拉曼年8月1日-年8月9日军人主席团（-）哈利迪·谢里夫年8月10日-年8月25日军人穆罕默德·巴卡尔年8月10日-年8月25日军人哈桑·阿里·Toilha年8月10日-年8月25日军人穆罕默德·巴卡尔年8月25日-年4月28日昂儒昂岛人运动Kaambi·胡迈迪年4月28日-年5月11日无党派Dhoihirou·哈利迪年5月11日-年6月14日无党派穆罕默德·巴卡尔年6月14日-年3月25日昂儒昂岛人运动IkililouDhoinine（临时）年3月26日-年3月31日无党派Lailizamane·阿卜杜·Cheik年3月31日-年7月7日无党派穆萨·Toybou年7月7日-年5月23日国家团结与发展AnissiChamsidine年5月23日-无党派莫埃利岛自治政府（-）
年8月11日，莫埃利岛宣布独立，建立姆瓦里民主共和国。年3月10日，经全民公投，取消独立，成为科摩罗联盟的一个自治区。
穆罕默德·Souef年8月11日-年空位年-年5月19日穆罕默德·赛义德·祖尔年5月19日-年5月19日科摩罗进步联盟空位年5月19日-年5月22日优素福·埃尔-法鲁克年5月22日-年7月1日穆罕默德·阿里·赛义德年7月1日-大科摩罗岛自治政府（-）
阿卜杜·苏莱·Elbak年5月29日-年5月30日正义阵线Soudjay·哈马迪年5月30日-年6月30日无党派穆罕默德·Abdouloihabi年6月30日-年5月23日总统选举联盟Mouigni·巴拉卡·赛义德·萨利赫年5月23日-橙色运动科摩罗联盟（-）
阿扎利·阿苏马尼年12月21日-年1月21日军人哈马达·马迪·博莱罗（临时）年1月21日-年5月26日科摩罗共和党阿扎利·阿苏马尼年5月26日-年5月26日复兴公约党艾哈迈德·穆罕默德·桑比年5月26日-年5月26日总统联盟伊基利卢·杜瓦尼纳年5月26日-年5月26日总统联盟阿扎利·阿苏马尼年5月26日-复兴公约党科摩罗（Comoros）。19世纪上半叶，法国人开始进入科摩罗地区，年法国入侵马约特岛。到年科摩罗四岛正式沦为法国殖民地。年成为法“海外领地”。年取得内部自治。年7月6日科摩罗宣布独立，成立科摩罗共和国。但来自马约特的代表对该决议投了弃权票，并决定继续接受法国的统治，在之后年和年的两次公决中，马约特依然反对从法国独立。年10月22日改国名为科摩罗伊斯兰联邦共和国。年，昂儒昂和莫赫利分别宣布从科摩罗独立，科摩罗政府之后试图以武力维护统一的行动未能成功。非洲联盟在南非总统姆贝基的主持下对各方进行了调解，各方同意每个岛都有一个自治政府，而之上则有一个三岛联合政府。年改国号为科摩罗联盟。
科摩罗联邦总统是科摩罗联盟的国家元首与政府首脑。大科摩罗岛、莫埃利岛以及昂儒昂岛每个岛都有自己的总统处理岛内事务，联邦总统由三岛总统轮流出任。
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